สำหรับเรื่องราวภายในเกม Sword Art Online: Hollow Fragment เนื่อเรื่องเริ่มจาก Kirito เจ้าของสกิลดาบคู่สุดเทพที่ได้ออกเดินทางไปสำรวจในพื้นที่ปิดอย่าง “Hollow Area” ใน Aincrad และได้พบเจอกับสาวผมทองสุดลึกลับซึ่งเป็นหนึ่งในตัวละครหลักของภาคนี้..และสำหรับในเกม Sword Art Online: Hollow Fragment นั้นจะมีระบบ Partner System ให้ผู้เล่นสามารถสวีทหวานเดินจับมือถือแขนกับตัวละครพาร์ทเนอร์ได้ หากมีค่าความสัมพันธ์กับตัวละครมากพอ ถ้าหากจับมือยังดูเด็กๆไปผู้เล่นยังสามารถอุ้มพาร์ทเนอร์ไว้ในอ้อมแขน ขณะเดินชมวิวทิวทัศน์ต่างๆในเมืองได้อีกด้วย